転写活性状態を制御する高次ゲノム構造形成因子の同定

プログラム

生命科学研究助成　

所属機関

九州大学

所属部署

生体防御医学研究所附属高深度オミクスサイエンスセンター 遺伝子発現動態学分野

キーワード

転写バースト　エンハンサー・プロモーター相互作用　3次元ゲノム構造　マウス胚性幹細胞　seq-DNA/RNA/IF-FISH

研究結果の概要

マウス胚性幹細胞を用い、転写バーストとエンハンサー・プロモーター近接の関係を、seq-DNA/RNA/IF-FISHおよび免疫染色を組み合わせて解析した。特定遺伝子の転写活性化状態では、周辺DNA領域の選択的近接と転写調節因子の局所集積が生じることを見出した。さらに数理シミュレーションにより、局所粘性の上昇が近接状態の持続を安定化し、転写バーストを支える可能性を示した。本成果はScience Advancesに公表済みである。

公表論文

Transcription-coupled changes in genomic regionproximities during transcriptional bursting,、Science Advances、vol.10、issue49、DOI: 10.1126/sciadv.adn0020