研究題目

Trans-ATポリケチド生合成遺伝子クラスターを持つ未開拓海洋細菌の探索および新規trans-ATポリケチド化合物の発見

プログラム: ライフサイエンス研究助成　
所属機関: 北里大学
所属部署: 海洋生命科学部　水族機能生物学研究室
申請者名: 上岡麗子
申請年度: 2022年度
キーワード: 天然物化学
研究結果の概要: 創薬において、天然由来の化合物は医薬品開発の元となるリード化合物として非常に重要な役割を果たしてきた。一方、近年では新たな天然化合物の発見が非常に困難になりつつある。本研究では、水圏環境で生息する未開拓な細菌を収集し天然化合物の探索源とした。また、これらの細菌のうち、ユニークな化学構造を持つ天然化合物を多く生合成することで知られるtrans-ATポリケチド合成酵素 (PKS) をゲノム中に持つ細菌の探索を行った。現在、新たに6株の異なる細菌中にtrans-AT PKSが含まれることが示唆されたため、全ゲノム解析および培養液抽出物中に含まれる二次代謝産物の解析を進めている。また、収集した他の細菌についても高分解能LCMSを用いて二次代謝産物の解析を行ったところ、海洋細菌Vibrio sp. AFB22-4-1の培養液抽出物中に新規天然化合物由来と思われる複数のイオンピークが確認された。そこで、イオンピークを指標にこれらの化合物を単離・構造決定したところ、新規ペプチド類であることが分かった。また、本細菌についても全ゲノム解析を行い、生合成遺伝子クラスターを特定した。
公表論文