トランスクプリトーム解析に基づいた集中治療室における重症患者の新規分子ネットワーク病態解明

プログラム

医学系研究助成　臨床

所属機関

大阪大学附属病院　救命救急センター

所属部署

救急医学講座

キーワード

重症患者　RNAシークエンス　ドライバー遺伝子

研究結果の概要

敗血症や重症熱傷など集中治療室の重症患者では、PAMPsやDAMPsがパターン認識受容体に結合して全身性炎症反応が惹起され、過剰な炎症はDICや多臓器障害といった致死的病態をきたす。従来は臨床症状に基づく重症分類が用いられてきたが、近年は網羅的遺伝子発現解析による宿主生体反応の評価が注目されている。申請者らはこれまで、急性期侵襲病態におけるサイトカイン（IL-6、IL-8、MCP-1、IL-10）がネットワークを形成し、重症度や予後と相関することを報告してきた。本研究では、illumina NovSeqを用いた全血RNAシークエンス（敗血症、重症熱傷、健常者）により、急性期侵襲病態の主要分子ネットワークを抽出する。エンリッチメント解析で主要シグナルを、トポロジー解析でドライバー遺伝子を同定し、遺伝子間相関に基づく分子ネットワークをスコア化する。このスコアで患者を層別化して予後との関連を評価し、予後予測マーカーおよび治療標的としての臨床的有用性を検証する。

公表論文

Significance of interferon signaling
based on mRNA-microRNA integration and plasma
protein analyses in critically ill COVID-19