研究題目
- 所属部署
- 未来先端研究機構 内分泌代謝 シグナル学研究部門 柴田研究室
- 申請年度
- 2022年度
- キーワード
- DNA損傷 HLAクラスI ネオアンチゲン 非典型的翻訳 がん治療
- 研究結果の概要
- 近年、DNA修復シグナル伝達に伴う免疫応答が注目されており、これまでに私たちは化学放射線治療によりDNA損傷を誘導するとHLAクラスIの提示が増強することを明らかにした。また、興味深いことに上記研究の過程で、DNA損傷により5’非翻訳領域から翻訳が開始され非典型的な翻訳産物由来の非自己抗原が生じている可能性が示唆された。そこで本研究では、リボソームプロファイリング (RP) 法によりDNA損傷依存的な翻訳開始点の変化について検討することにした。リボソームが結合したmRNAからリボソームフットプリントを精製・抽出した後、ライブラリーを調製しシーケンスを解析した。rRNAやtRNAのコンタミネーションを除いた後、リードをゲノムにマッピングし、ゲノムブラウザによる可視化およびMetagene解析を行った。その結果、RP法の特徴である次の3点が確認でき ((1) 翻訳領域特異的なシグナル、(2) 3塩基周期性、(3) ハリングトニン処理により翻訳開始点にリボソームが濃縮される)、実験系が適切にワークしていると考えられた。今後は、DNA損傷に応答して変化する翻訳開始点の同定を試みる予定である。
- 公表論文
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Regulation of DNA damage-induced HLA class I presentation. DNA Repair (Amst). Uchihara Y, Shibata A. 2023 Dec;132:103590. doi: 10.1016/j.dnarep.2023.103590. Epub 2023 Nov 1. PMID: 37944422.
