研究題目
- 所属部署
- 医薬保健研究域医学系 分子細胞病理学
- 申請年度
- 2023年度
- キーワード
- 神経内分泌腫瘍 小細胞肺癌 マルチオミックス
- 研究結果の概要
- 神経内分泌腫瘍におけるエピゲノム制御と転写制御機構の解明を目的に、①H3K27ac CUT&Tag解析によりサブタイプ特異的SE-miRNAとしてmiR-375、miR-7、miR-9を同定し、miR-375が神経内分泌形質および予後不良と関連することを示した。さらに、血清エクソソーム中miR-375が神経内分泌形質を反映する液性バイオマーカーとなる可能性を見出し、臨床応用に向けた展開を進めている。②病理解剖検体バイオバンクを構築するとともに、ATAC-seq解析系を整備し、rapid autopsy検体を用いた全身横断的エピゲノム解析の実現可能性を示した。③空間マルチオミクス解析により、腫瘍細胞の可塑性に関わる状態遷移を捉えるとともに、MMP12陽性腫瘍関連マクロファージを介した特徴的な腫瘍微小環境を明らかにした。以上の成果により、神経内分泌腫瘍の多様性と治療抵抗性を理解するための基盤を築き、新規バイオマーカーおよび治療標的探索への展開可能性を示した。
- 公表論文
-
Characteristic miRNA profiles represent clinicopathological diversity of small cell lung cancer. J Pathol. 2025;267:168-180.
Integrative epigenome and transcriptome analyses reveal transcriptional programs differentially regulated by ASCL1 and NEUROD1 in small cell lung cancer. Oncogene. 2025;44:3113-3125.
An integrative epigenomic approach identifies ELF3 as an oncogenic regulator in ASCL1-positive neuroendocrine carcinoma. Cancer Sci. 2023;114:2596-2608.
研究題目
- 所属部署
- ゲノム生物学講座 がんゲノム情報学教室
- 申請年度
- 2021年度
- キーワード
- 神経内分泌癌 ELF3 ATAC-seq CUT&Tag super-enhancer
- 研究結果の概要
- 神経内分泌癌は呼吸器系、及び消化器系に好発するが、膵・消化管神経内分泌癌、及び小細胞肺癌はいずれも極めて悪性度の高い組織型である。近年の分子遺伝学的解析によりそのサブタイプについては整理されつつあるが（Yachida*, Horie* et al. Cancer Discov. 2022., Horie et al. J Pathol. 2018., Horie et al. Cancer Sci. 2016.）、そのエピゲノムについては不明なままである。本研究ではATAC-seqとCUT&Tagによる臓器横断的は神経内分泌癌の包括的なエピゲノム解析を行い、癌抑制遺伝子と知られている転写因子ELF3をスーパーエンハンサー関連転写因子として新たに同定した。さらにELF3の下流のシグナル解析やin vitro解析により、ELF3が神経内分泌癌ではマスター転写因子として癌促進的な役割を果たしていることを明らかにし、ELF3のcontext-dependentな二面性を初めて示すことができた。以上より神経内分泌癌の臓器横断的な理解と治療戦略開発に貢献する成果を示した。
- 公表論文
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An integrative epigenomic approach identifies ELF3 as an oncogenic regulator in ASCL1-positive neuroendocrine carcinoma.
Cancer Sci. 2023 Jun;114(6):2596-2608.
