- 所属部署
- 研究所 がんRNA研究ユニット
- 申請年度
- 2021年度
- キーワード
- RNA processing 臓器横断的 RNAスプライシング Transcriptome バイオマーカー
- 研究結果の概要
- 本研究では、最先端のsplicing解析技術をがん横断的に用いることにより、各種のがんにおけるゲノム、遺伝子発現、splicingの多層的な異常をOmics解析で同定した。また、23万件以上に及ぶRNAシークエンスデータの解析を元に、27,000以上の病的意義のある新規splicing-associated variant(SAV)を同定した。さらに、膀胱がんにおけるOmics解析では、ゲノム・transcriptome異常が腫瘍免疫微小環境に与える影響を解明するとともに、臨床的意義のあるバイオマーカーを同定した。また、antisense oligonucleotide（ASO）の標的配列やDrug delivery system（DDS）の最適化を通して、TP53異常を有するがんやEwing肉腫を標的とする新規治療法の開発につながった。
- 公表論文
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(#co-corresponding)
1.The Impact of FGFR3 Alterations on the Tumor Microenvironment and the Efficacy of Immune Checkpoint Inhibitors in Bladder Cancer. Mol Cancer. 2023 Nov 18;22(1):185. Komura K#, Hirosuna K, Tokushige S, Nishimura K, Ishida M, Hayashi T, Ura A, Ohno T, Yamazaki S, Nakamori K, Kinoshita S, Tsujino T, Maenosono R, Ajiro M, (…11名省略), Yoshimi A#, Azuma H.
2.Tertiary lymphoid structure and neutrophil-lymphocyte ratio coordinately predict outcome of pembrolizumab. Cancer Sci. 2023 Dec;114(12):4622-4631. Komura K#, Tokushige S, Ishida M, Hirosuna K, Yamazaki S, Nishimura K, Ajiro M, Ohno T, Nakamori K, Kinoshita S, Tsujino T, Maenosono R, Yoshikawa Y, Takai T, Tsutsumi T, Taniguchi K, Tanaka T, Takahara K, Inamoto T, Hirose Y, Ono F, Shiraishi Y, Yoshimi A#, Azuma H.
3.Pathogenic roles of RNA-Binding Proteins in Sarcomas. Cancers. 2022 Aug 5;14(15):3812. Hai Y, Kawachi A, He X, Yoshimi A#.
