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申請者名浅田 健

研究題目

Pan-negative 肺がん症例における特異的な signature 探索とマルチオミックス解析を用いたがん分子メ カニズムの解明

プログラム
医学系研究助成 がん領域(基礎)
所属機関
理化学研究所
所属部署
革新知能統合研究センター がん探索医療研究チーム
申請年度
2021年度
キーワード
肺がん 変異シグネチャー マルチオミックス解析
研究結果の概要
本研究ではがんドライバー変異が同定されていない肺腺がん症例に着目し、ゲノム・エピゲノム・トランスクリプトーム情報を用いて、がんの本態解明を指向した解析を行なった。全ゲノム情報を利用した解析からnon-coding領域であるプロモーターおよびエンハンサー領域で異なる変異シグネチャーが見出され、領域特異的な変異選択圧の存在が明らかとなった。さらなる解析をすすめた結果、肺腺がん症例で有意に発現が抑制されている遺伝子を見出し、その遺伝子領域におけるゲノム変異とエンハンサー活性との相関が明らかとなった。また同定した遺伝子の発現解析と他遺伝子との相関解析から、肺腺がんにおける複数の予後予測マーカーが同定された。
公表論文
Multi-omics and clustering analyses reveal the mechanisms underlying unmet needs for patients with lung adenocarcinoma and identify potential therapeutic targets,Molecular Cancer volume 23, Article number: 182 (2024)
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